# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 23 13 6 4 27:12 15 45 1.96
2 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 22 11 7 4 27:15 12 40 1.82
3 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 22 10 7 5 22:9 13 37 1.68
4 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 23 10 8 5 23:13 10 38 1.65
5 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 23 10 6 7 20:12 8 36 1.57
6 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 22 7 10 5 10:9 1 31 1.41
7 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 23 8 8 7 13:15 -2 32 1.39
8 TSV Aubstadt, Deutschland TSV Aubstadt 22 7 9 6 15:12 3 30 1.36
9 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 22 7 7 8 16:20 -4 28 1.27
10 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 23 6 11 6 13:11 2 29 1.26
11 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 22 5 10 7 14:13 1 25 1.14
12 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 21 5 9 7 11:16 -5 24 1.14
13 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 23 6 8 9 18:26 -8 26 1.13
14 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 20 6 4 10 13:23 -10 22 1.10
15 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 21 4 10 7 6:14 -8 22 1.05
16 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 23 3 9 11 7:19 -12 18 0.78
17 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 23 4 5 14 10:26 -16 17 0.74
18 Türkgücü München, Deutschland Türkgücü München 0 0 0 0 0:0 0 0
  Playoffs
  Playoffs
  Abstieg

# Im Zuge der Unterbrechung durch die Corona-Epidemie und der späteren Fortführung der Liga hatte der Bayerische Fußball-Verband beschlossen, alle Spiele von Türkgücü München (Aufsteiger in die 3. Liga 2020/2021) aus der Wertung der gesamten Spielzeit zu nehmen.

# Wegen der Coronavirus-Pandemie konnte die Saison nicht zu Ende gespielt werden. Stattdessen wurden Playoffs zwischen Bayreuth, Schweinfurt und Aschaffenburg angesetzt, um den für die Aufstiegsrunde zur 3. Liga berechtigten Verein zu ermittteln.