# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 24 13 7 4 27:12 15 46 1.92
2 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 23 11 8 4 27:15 12 41 1.78
3 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 23 10 8 5 22:9 13 38 1.65
4 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 23 10 8 5 23:13 10 38 1.65
5 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 24 10 6 8 20:14 6 36 1.50
6 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 23 8 10 5 12:9 3 34 1.48
7 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 23 8 8 7 13:15 -2 32 1.39
8 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 23 8 7 8 18:20 -2 31 1.35
9 TSV Aubstadt, Deutschland TSV Aubstadt 23 7 9 7 15:13 2 30 1.30
10 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 23 6 10 7 15:13 2 28 1.22
11 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 24 6 11 7 13:13 0 29 1.21
12 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 24 7 8 9 19:26 -7 29 1.21
13 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 20 6 4 10 13:23 -10 22 1.10
14 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 22 5 9 8 11:17 -6 24 1.09
15 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 21 4 10 7 6:14 -8 22 1.05
16 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 23 3 9 11 7:19 -12 18 0.78
17 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 24 4 6 14 10:26 -16 18 0.75
18 Türkgücü München, Deutschland Türkgücü München 0 0 0 0 0:0 0 0
  Playoffs
  Playoffs
  Abstieg

# Im Zuge der Unterbrechung durch die Corona-Epidemie und der späteren Fortführung der Liga hatte der Bayerische Fußball-Verband beschlossen, alle Spiele von Türkgücü München (Aufsteiger in die 3. Liga 2020/2021) aus der Wertung der gesamten Spielzeit zu nehmen.

# Wegen der Coronavirus-Pandemie konnte die Saison nicht zu Ende gespielt werden. Stattdessen wurden Playoffs zwischen Bayreuth, Schweinfurt und Aschaffenburg angesetzt, um den für die Aufstiegsrunde zur 3. Liga berechtigten Verein zu ermittteln.