# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 24 14 5 5 49:26 23 47 1.96
2 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 24 13 7 4 55:29 26 46 1.92
3 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 24 13 7 4 51:27 24 46 1.92
4 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 23 14 2 7 48:29 19 44 1.91
5 TSV Aubstadt, Deutschland TSV Aubstadt 24 11 6 7 40:35 5 39 1.63
6 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 25 10 7 8 45:30 15 37 1.48
7 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 24 9 8 7 32:28 4 35 1.46
8 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 25 10 6 9 30:31 -1 36 1.44
9 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 24 9 7 8 42:32 10 34 1.42
10 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 23 9 5 9 33:43 -10 32 1.39
11 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 24 8 6 10 33:33 0 30 1.25
12 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 24 8 4 12 35:50 -15 28 1.17
13 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 24 8 3 13 25:41 -16 27 1.13
14 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 25 8 2 15 44:54 -10 26 1.04
15 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 22 4 8 10 18:30 -12 20 0.91
16 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 25 6 3 16 30:61 -31 21 0.84
17 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 20 3 4 13 21:52 -31 13 0.65
18 Türkgücü München, Deutschland Türkgücü München 0 0 0 0 0:0 0 0
  Playoffs
  Playoffs
  Abstieg

# Im Zuge der Unterbrechung durch die Corona-Epidemie und der späteren Fortführung der Liga hatte der Bayerische Fußball-Verband beschlossen, alle Spiele von Türkgücü München (Aufsteiger in die 3. Liga 2020/2021) aus der Wertung der gesamten Spielzeit zu nehmen.

# Wegen der Coronavirus-Pandemie konnte die Saison nicht zu Ende gespielt werden. Stattdessen wurden Playoffs zwischen Bayreuth, Schweinfurt und Aschaffenburg angesetzt, um den für die Aufstiegsrunde zur 3. Liga berechtigten Verein zu ermittteln.