# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 24 11 10 3 32:15 17 43 1.79
2 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 24 11 8 5 24:15 9 41 1.71
3 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 23 11 6 6 26:20 6 39 1.70
4 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 24 11 7 6 22:11 11 40 1.67
5 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 24 11 7 6 27:19 8 40 1.67
6 TSV Aubstadt, Deutschland TSV Aubstadt 24 10 7 7 23:22 1 37 1.54
7 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 25 10 8 7 24:16 8 38 1.52
8 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 25 10 7 8 17:18 -1 37 1.48
9 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 23 9 5 9 20:26 -6 32 1.39
10 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 24 8 9 7 19:18 1 33 1.38
11 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 24 7 10 7 20:18 2 31 1.29
12 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 25 10 1 14 25:28 -3 31 1.24
13 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 22 5 9 8 12:16 -4 24 1.09
14 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 24 6 8 10 18:22 -4 26 1.08
15 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 25 8 2 15 20:33 -13 26 1.04
16 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 24 6 5 13 17:28 -11 23 0.96
17 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 20 1 5 14 8:29 -21 8 0.40
18 Türkgücü München, Deutschland Türkgücü München 0 0 0 0 0:0 0 0
  Playoffs
  Playoffs
  Abstieg

# Im Zuge der Unterbrechung durch die Corona-Epidemie und der späteren Fortführung der Liga hatte der Bayerische Fußball-Verband beschlossen, alle Spiele von Türkgücü München (Aufsteiger in die 3. Liga 2020/2021) aus der Wertung der gesamten Spielzeit zu nehmen.

# Wegen der Coronavirus-Pandemie konnte die Saison nicht zu Ende gespielt werden. Stattdessen wurden Playoffs zwischen Bayreuth, Schweinfurt und Aschaffenburg angesetzt, um den für die Aufstiegsrunde zur 3. Liga berechtigten Verein zu ermittteln.