# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 12 7 2 3 20:15 5 23 1.92
2 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 12 6 4 2 23:13 10 22 1.83
3 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 13 6 4 3 22:18 4 22 1.69
4 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 12 5 2 5 21:15 6 17 1.42
5 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 12 5 2 5 12:17 -5 17 1.42
6 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 13 5 2 6 25:20 5 17 1.31
7 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 12 4 3 5 18:20 -2 15 1.25
8 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 11 3 3 5 17:29 -12 12 1.09
9 TSV Aubstadt, Deutschland TSV Aubstadt 12 3 3 6 16:25 -9 12 1.00
10 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 12 2 5 5 8:15 -7 11 0.92
11 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 11 2 4 5 11:13 -2 10 0.91
12 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 11 3 1 7 8:21 -13 10 0.91
13 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 11 3 1 7 15:31 -16 10 0.91
14 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 12 2 4 6 16:28 -12 10 0.83
15 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 12 2 3 7 8:18 -10 9 0.75
16 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 12 2 1 9 19:29 -10 7 0.58
17 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 12 2 1 9 15:30 -15 7 0.58
18 Türkgücü München, Deutschland Türkgücü München 0 0 0 0 0:0 0 0
  Playoffs
  Playoffs
  Abstieg

# Im Zuge der Unterbrechung durch die Corona-Epidemie und der späteren Fortführung der Liga hatte der Bayerische Fußball-Verband beschlossen, alle Spiele von Türkgücü München (Aufsteiger in die 3. Liga 2020/2021) aus der Wertung der gesamten Spielzeit zu nehmen.

# Wegen der Coronavirus-Pandemie konnte die Saison nicht zu Ende gespielt werden. Stattdessen wurden Playoffs zwischen Bayreuth, Schweinfurt und Aschaffenburg angesetzt, um den für die Aufstiegsrunde zur 3. Liga berechtigten Verein zu ermittteln.