# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 25 13 7 5 27:13 14 46 1.84
2 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 25 11 10 4 28:16 12 43 1.72
3 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 23 10 8 5 22:9 13 38 1.65
4 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 26 12 6 8 22:14 8 42 1.62
5 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 25 10 9 6 24:15 9 39 1.56
6 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 25 9 9 7 15:16 -1 36 1.44
7 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 25 8 11 6 12:10 2 35 1.40
8 TSV Aubstadt, Deutschland TSV Aubstadt 25 8 10 7 18:14 4 34 1.36
9 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 25 8 8 9 19:23 -4 32 1.28
10 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 25 6 12 7 16:14 2 30 1.20
11 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 25 7 9 9 19:26 -7 30 1.20
12 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 26 6 13 7 14:14 0 31 1.19
13 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 24 6 10 8 14:18 -4 28 1.17
14 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 20 6 4 10 13:23 -10 22 1.10
15 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 22 4 11 7 6:14 -8 23 1.05
16 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 25 3 11 11 7:19 -12 20 0.80
17 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 25 4 6 15 10:28 -18 18 0.72
18 Türkgücü München, Deutschland Türkgücü München 0 0 0 0 0:0 0 0
  Playoffs
  Playoffs
  Abstieg

# Im Zuge der Unterbrechung durch die Corona-Epidemie und der späteren Fortführung der Liga hatte der Bayerische Fußball-Verband beschlossen, alle Spiele von Türkgücü München (Aufsteiger in die 3. Liga 2020/2021) aus der Wertung der gesamten Spielzeit zu nehmen.

# Wegen der Coronavirus-Pandemie konnte die Saison nicht zu Ende gespielt werden. Stattdessen wurden Playoffs zwischen Bayreuth, Schweinfurt und Aschaffenburg angesetzt, um den für die Aufstiegsrunde zur 3. Liga berechtigten Verein zu ermittteln.