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| 31.03.2006 | 19:30 | SG Wattenscheid 09 | - | VfL Osnabrück | 3:3 (1:0) | |
| 01.04.2006 | 14:00 | Rot-Weiß Erfurt | - | Bayer Leverkusen II | 3:1 (1:1) | |
| 14:00 | Kickers Emden | - | Wuppertaler SV | 2:0 (0:0) | ||
| 14:00 | VfB Lübeck | - | Rot-Weiß Oberhausen | 4:0 (2:0) | ||
| 14:00 | Rot-Weiss Essen | - | Holstein Kiel | 2:1 (1:1) | ||
| 14:00 | 1. FC Köln II | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:1 (1:0) | ||
| 14:00 | FC St. Pauli | - | Chemnitzer FC | 3:2 (0:1) | ||
| 02.04.2006 | 14:00 | Hamburger SV II | - | Preußen Münster | 0:2 (0:1) | |
| 14:00 | Werder Bremen II | - | Hertha BSC II | 2:1 (0:0) |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
Rot-Weiss Essen | 29 | 19 | 5 | 5 | 55:28 | 27 | 62 |
| 2 |
|
FC Carl Zeiss Jena | 28 | 18 | 4 | 6 | 51:28 | 23 | 58 |
| 3 |
|
VfB Lübeck | 28 | 16 | 8 | 4 | 46:26 | 20 | 56 |
| 4 |
|
Holstein Kiel | 28 | 16 | 7 | 5 | 50:30 | 20 | 55 |
| 5 |
|
FC St. Pauli | 29 | 15 | 8 | 6 | 45:28 | 17 | 53 |
| 6 |
|
Hertha BSC II | 29 | 13 | 5 | 11 | 46:38 | 8 | 44 |
| 7 |
|
Fortuna Düsseldorf | 28 | 12 | 8 | 8 | 45:37 | 8 | 44 |
| 8 |
|
VfL Osnabrück | 28 | 12 | 5 | 11 | 48:44 | 4 | 41 |
| 9 |
|
Wuppertaler SV | 29 | 10 | 10 | 9 | 32:34 | -2 | 40 |
| 10 |
|
Kickers Emden | 28 | 10 | 6 | 12 | 38:37 | 1 | 36 |
| 11 |
|
Hamburger SV II | 28 | 9 | 6 | 13 | 32:35 | -3 | 33 |
| 12 |
|
Rot-Weiß Erfurt | 28 | 9 | 6 | 13 | 32:42 | -10 | 33 |
| 13 |
|
SG Wattenscheid 09 | 29 | 8 | 8 | 13 | 40:50 | -10 | 32 |
| 14 |
|
Bayer Leverkusen II | 29 | 9 | 5 | 15 | 43:54 | -11 | 32 |
| 15 |
|
Preußen Münster | 28 | 9 | 5 | 14 | 27:40 | -13 | 32 |
| 16 |
|
Rot-Weiß Oberhausen | 29 | 7 | 9 | 13 | 24:40 | -16 | 30 |
| 17 |
|
Werder Bremen II | 28 | 8 | 5 | 15 | 35:42 | -7 | 29 |
| 18 |
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1. FC Köln II | 29 | 6 | 5 | 18 | 32:56 | -24 | 23 |
| 19 |
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Chemnitzer FC | 28 | 4 | 5 | 19 | 26:58 | -32 | 17 |
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# Das Spiel Fortuna Düsseldorf - Kickers Emden (9. Spieltag, 1:2) wurde mit 2:0 für die Gastgeber gewertet. Die Dopingprobe des Emdener Falk Schindler nach dem Spiel wurde positiv getestet. |
