# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Holstein Kiel, Deutschland Holstein Kiel 2 2 0 0 7:1 6 6
2 Hannover 96 II, Deutschland Hannover 96 II 2 2 0 0 4:1 3 6
3 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 2 2 0 0 3:1 2 6
4 Hamburger SV II, Deutschland Hamburger SV II 2 1 1 0 5:1 4 4
5 SV Wilhelmshaven, Deutschland SV Wilhelmshaven 2 1 1 0 3:1 2 4
6 SV Babelsberg 03, Deutschland SV Babelsberg 03 2 1 1 0 2:1 1 4
7 Altona 93, Deutschland Altona 93 2 1 0 1 3:2 1 3
8 VfL Wolfsburg II, Deutschland VfL Wolfsburg II 2 1 0 1 2:1 1 3
9 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 2 1 0 1 2:2 0 3
10 Türkiyemspor Berlin, Deutschland Türkiyemspor Berlin 2 1 0 1 3:4 -1 3
11 VFC Plauen, Deutschland VFC Plauen 2 0 2 0 2:2 0 2
12 Energie Cottbus II, Deutschland Energie Cottbus II 2 0 1 1 2:3 -1 1
13 FC Oberneuland, Deutschland FC Oberneuland 2 0 1 1 1:2 -1 1
  Sachsen Leipzig, Deutschland Sachsen Leipzig 2 0 1 1 1:2 -1 1
15 Hertha BSC II, Deutschland Hertha BSC II 2 0 1 1 2:6 -4 1
16 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 2 0 0 2 3:5 -2 0
17 VfB Lübeck, Deutschland VfB Lübeck 2 0 0 2 1:3 -2 0
18 Hansa Rostock II, Deutschland Hansa Rostock II 2 0 0 2 0:5 -5 0
  Aufstieg
  Abstieg

# Sachsen Leipzig hat am 4. März 2009 einen Insolvenzantrag gestellt. Der Verein steht damit als erster Absteiger aus der Regionalliga Nord fest.

# Altona 93 erhält keine Lizenz für die Saison 2009/2010 und steht damit als Absteiger fest.

# Türkiyemspor Berlin hält trotz Rang 15 die Klasse, da Kickes Emden nach dem Lizenzrückzug für die 3. Liga in der Saison 2009/2010 in der Oberliga startet.