5. Spieltag 25.08.2006 1. FC Union Berlin - Kickers Emden 1:0
9. Spieltag 23.09.2006 1. FC Union Berlin - Bor. Mönchengladbach II 3:1
10. Spieltag 01.10.2006 Rot Weiss Ahlen - 1. FC Union Berlin 0:1
11. Spieltag 14.10.2006 1. FC Union Berlin - VfL Osnabrück 2:2 gelbe Karte
12. Spieltag 20.10.2006 Fortuna Düsseldorf - 1. FC Union Berlin 2:1 Tor
13. Spieltag 28.10.2006 1. FC Union Berlin - Rot-Weiß Erfurt 2:4 Tor gelbe Karte
14. Spieltag 04.11.2006 Dynamo Dresden - 1. FC Union Berlin 2:0 gelbe Karte
15. Spieltag 08.11.2006 1. FC Union Berlin - 1. FC Magdeburg 1:2 Tor
16. Spieltag 11.11.2006 Wuppertaler SV - 1. FC Union Berlin 2:1 gelbe Karte
17. Spieltag 18.11.2006 1. FC Union Berlin - Borussia Dortmund II 2:0
18. Spieltag 25.11.2006 VfB Lübeck - 1. FC Union Berlin 0:1
19. Spieltag 01.12.2006 1. FC Union Berlin - Werder Bremen II 0:2
20. Spieltag 09.12.2006 1. FC Union Berlin - Hertha BSC II 2:2
22. Spieltag 16.02.2007 SV Wilhelmshaven - 1. FC Union Berlin 0:0
23. Spieltag 23.02.2007 1. FC Union Berlin - Bayer Leverkusen II 4:0
25. Spieltag 10.03.2007 1. FC Union Berlin - FC St. Pauli 2:0 gelbe Karte
28. Spieltag 28.03.2007 Bor. Mönchengladbach II - 1. FC Union Berlin 0:3 gelbe Karte
29. Spieltag 31.03.2007 1. FC Union Berlin - Rot Weiss Ahlen 1:1
27. Spieltag 04.04.2007 1. FC Union Berlin - Holstein Kiel 0:2
30. Spieltag 07.04.2007 VfL Osnabrück - 1. FC Union Berlin 1:0
31. Spieltag 14.04.2007 1. FC Union Berlin - Fortuna Düsseldorf 1:0
35. Spieltag 11.05.2007 1. FC Union Berlin - Wuppertaler SV 0:3
37. Spieltag 26.05.2007 1. FC Union Berlin - VfB Lübeck 1:1