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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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MSV Duisburg | 26 | 12 | 12 | 2 | 19:6 | 13 | 48 |
| 2 |
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Alemannia Aachen | 26 | 12 | 8 | 6 | 23:12 | 11 | 44 |
| 3 |
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SpVgg Greuther Fürth | 26 | 11 | 10 | 5 | 19:13 | 6 | 43 |
| 4 |
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Eintracht Frankfurt | 26 | 11 | 8 | 7 | 22:16 | 6 | 41 |
| 5 |
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Erzgebirge Aue | 26 | 9 | 11 | 6 | 16:10 | 6 | 38 |
| 6 |
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TSV 1860 München | 26 | 8 | 12 | 6 | 17:14 | 3 | 36 |
| 7 |
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Karlsruher SC | 26 | 9 | 8 | 9 | 19:21 | -2 | 35 |
| 8 |
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LR Ahlen | 26 | 7 | 12 | 7 | 14:15 | -1 | 33 |
| 9 |
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Dynamo Dresden | 26 | 8 | 8 | 10 | 16:16 | 0 | 32 |
| 10 |
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SpVgg Unterhaching | 26 | 8 | 7 | 11 | 17:17 | 0 | 31 |
| 11 |
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1. FC Saarbrücken | 26 | 9 | 4 | 13 | 16:22 | -6 | 31 |
| 12 |
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1. FC Köln | 26 | 6 | 12 | 8 | 18:13 | 5 | 30 |
| 13 |
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Energie Cottbus | 26 | 5 | 15 | 6 | 12:14 | -2 | 30 |
| 14 |
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Wacker Burghausen | 26 | 7 | 9 | 10 | 10:16 | -6 | 30 |
| 15 |
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Rot-Weiss Essen | 26 | 6 | 12 | 8 | 12:19 | -7 | 30 |
| 16 |
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Rot-Weiß Oberhausen | 26 | 7 | 7 | 12 | 13:24 | -11 | 28 |
| 17 |
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Eintracht Trier | 26 | 5 | 12 | 9 | 15:20 | -5 | 27 |
| 18 |
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Rot-Weiß Erfurt | 26 | 5 | 11 | 10 | 10:20 | -10 | 26 |
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# Das Spiel LR Ahlen - Wacker Burghausen (1:0, 9. Spieltag) wurde wegen des Wettskandals annulliert. Das Wiederholungsspiel gewannen die Gäste mit 3:1. # Das Spiel Rot-Weiß Erfurt - SpVgg Unterhaching (24. Spieltag, 2:0) wurde mit 0:2 gewertet. Der Erfurter Senad Tiganj wurde des Dopings überführt. |
