1. Spieltag 18.07.2016 TSV 1860 München II - FC Ingolstadt 04 II 2:1
3. Spieltag 30.07.2016 SpVgg Bayern Hof - TSV 1860 München II 1:3
4. Spieltag 02.08.2016 TSV 1860 München II - TSV 1860 Rosenheim 1:0
5. Spieltag 06.08.2016 VfR Garching - TSV 1860 München II 1:2
7. Spieltag 21.08.2016 SpVgg Greuther Fürth II - TSV 1860 München II 1:2
8. Spieltag 28.08.2016 TSV 1860 München II - Bayern München II 0:0
10. Spieltag 09.09.2016 TSV 1860 München II - SV Schalding-Heining 2:0
11. Spieltag 17.09.2016 1. FC Schweinfurt 05 - TSV 1860 München II 1:2 gelbe Karte
12. Spieltag 24.09.2016 TSV 1860 München II - 1. FC Nürnberg II 1:4
13. Spieltag 01.10.2016 FV Illertissen - TSV 1860 München II 2:0
9. Spieltag 19.10.2016 FC Augsburg II - TSV 1860 München II 1:0
16. Spieltag 22.10.2016 TSV 1860 München II - TSV Buchbach 3:1
17. Spieltag 29.10.2016 SpVgg Unterhaching - TSV 1860 München II 0:0
18. Spieltag 04.11.2016 FC Ingolstadt 04 II - TSV 1860 München II 0:0
19. Spieltag 12.11.2016 TSV 1860 München II - SpVgg Bayreuth 1:1
20. Spieltag 19.11.2016 TSV 1860 Rosenheim - TSV 1860 München II 2:0 gelbe Karte
22. Spieltag 04.03.2017 FC Memmingen - TSV 1860 München II 0:1 gelbe Karte
25. Spieltag 12.03.2017 Bayern München II - TSV 1860 München II 0:2
24. Spieltag 18.03.2017 TSV 1860 München II - FC Augsburg II 1:0
23. Spieltag 21.03.2017 TSV 1860 München II - SpVgg Greuther Fürth II 3:0
26. Spieltag 01.04.2017 SV Schalding-Heining - TSV 1860 München II 1:3
28. Spieltag 13.04.2017 1. FC Nürnberg II - TSV 1860 München II 0:1
29. Spieltag 18.04.2017 TSV 1860 München II - FV Illertissen 2:2
30. Spieltag 22.04.2017 TSV 1860 München II - SpVgg Bayern Hof 0:2
31. Spieltag 29.04.2017 SV Seligenporten - TSV 1860 München II 1:2 gelbe Karte
32. Spieltag 06.05.2017 TSV 1860 München II - Wacker Burghausen 2:2 Tor gelbe Karte
34. Spieltag 19.05.2017 TSV 1860 München II - SpVgg Unterhaching 0:3