| 2. Spieltag | 28.07.2012 | SpVgg Unterhaching | - | Hansa Rostock | 3:0 | ||||
| 8. Spieltag | 01.09.2012 | SpVgg Unterhaching | - | Arminia Bielefeld | 3:2 |  |
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| 9. Spieltag | 15.09.2012 | Alemannia Aachen | - | SpVgg Unterhaching | 1:3 | ||||
| 10. Spieltag | 22.09.2012 | SpVgg Unterhaching | - | Borussia Dortmund II | 4:3 | |
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| 11. Spieltag | 26.09.2012 | 1. FC Saarbrücken | - | SpVgg Unterhaching | 2:4 | |
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| 12. Spieltag | 30.09.2012 | SpVgg Unterhaching | - | Kickers Offenbach | 0:3 | ||||
| 13. Spieltag | 06.10.2012 | Karlsruher SC | - | SpVgg Unterhaching | 0:0 | ||||
| 14. Spieltag | 20.10.2012 | SpVgg Unterhaching | - | Rot-Weiß Erfurt | 2:2 | ||||
| 16. Spieltag | 02.11.2012 | SpVgg Unterhaching | - | Wacker Burghausen | 3:0 | ||||
| 17. Spieltag | 09.11.2012 | SpVgg Unterhaching | - | SV Babelsberg 03 | 0:1 | ||||
| 15. Spieltag | 13.11.2012 | Stuttgarter Kickers | - | SpVgg Unterhaching | 0:0 | ||||
| 18. Spieltag | 17.11.2012 | Preußen Münster | - | SpVgg Unterhaching | 0:0 |  |
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