| 18. Spieltag | 15.02.1998 | SG Wattenscheid 09 | - | FC Carl Zeiss Jena | 2:0 | ||||
| 19. Spieltag | 22.02.1998 | FC Carl Zeiss Jena | - | Stuttgarter Kickers | 2:1 | ||||
| 20. Spieltag | 01.03.1998 | Energie Cottbus | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:0 | ||||
| 21. Spieltag | 06.03.1998 | FC Carl Zeiss Jena | - | 1. FC Nürnberg | 0:3 | ||||
| 22. Spieltag | 13.03.1998 | SC Freiburg | - | FC Carl Zeiss Jena | 1:1 |  |
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| 25. Spieltag | 03.04.1998 | Eintracht Frankfurt | - | FC Carl Zeiss Jena | 2:2 | ||||
| 26. Spieltag | 12.04.1998 | FC Carl Zeiss Jena | - | KFC Uerdingen 05 | 0:3 | ||||
| 27. Spieltag | 19.04.1998 | SV Meppen | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:2 | |
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| 28. Spieltag | 29.04.1998 | FC Carl Zeiss Jena | - | SpVgg Unterhaching | 2:3 | |
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| 29. Spieltag | 03.05.1998 | SpVgg Greuther Fürth | - | FC Carl Zeiss Jena | 3:0 | |
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| 30. Spieltag | 08.05.1998 | FC Carl Zeiss Jena | - | FC St. Pauli | 1:1 | ||||
| 31. Spieltag | 15.05.1998 | 1. FSV Mainz 05 | - | FC Carl Zeiss Jena | 5:0 | ||||
| 32. Spieltag | 20.05.1998 | FC Carl Zeiss Jena | - | FSV Zwickau | 2:3 | ||||
| 23. Spieltag | 26.05.1998 | FC Carl Zeiss Jena | - | VfB Leipzig | 0:0 | |
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| 34. Spieltag | 07.06.1998 | FC Carl Zeiss Jena | - | Fortuna Düsseldorf | 3:4 |
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