# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Bayern München II, Deutschland Bayern München II 25 17 5 3 56:21 35 56
2 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 25 15 6 4 50:27 23 51
3 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 25 11 11 3 42:29 13 44
4 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 25 12 6 7 43:37 6 42
5 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 25 11 7 7 35:25 10 40
6 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 25 10 7 8 40:30 10 37
7 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 25 10 6 9 30:29 1 36
8 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 25 9 7 9 30:36 -6 34
9 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 25 9 6 10 35:33 2 33
10 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 25 9 5 11 38:44 -6 32
11 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 25 7 9 9 35:42 -7 30
12 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 25 8 5 12 34:34 0 29
13 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 25 7 7 11 31:38 -7 28
14 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 25 7 5 13 29:39 -10 26
15 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 25 6 5 14 35:51 -16 23
16 FC Pipinsried, Deutschland FC Pipinsried 25 5 8 12 36:53 -17 23
17 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 25 6 5 14 20:43 -23 23
18 FC Ingolstadt 04 II, Deutschland FC Ingolstadt 04 II 25 8 6 11 31:39 -8 -15
  Playoffs
  Relegation
  Abstieg

# Durch den Abstieg der Profimannschaft des FC Ingolstadt 04 in die 3. Liga wurde der FC Ingolstadt 04 II mit 0 Punkten an das Ende der Tabelle gesetzt. Die erspielten Ergebnisse behalten aber ihre Gültigkeit. Das Team lag am Ende der Saison eigentlich mit 45 Punkten auf dem neunten Tabellenplatz.