# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Bayern München II, Deutschland Bayern München II 5 5 0 0 15:3 12 15
2 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 5 4 1 0 8:2 6 13
3 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 6 4 0 2 13:12 1 12
4 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 5 3 1 1 12:8 4 10
5 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 4 3 0 1 7:5 2 9
6 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 4 2 1 1 6:2 4 7
7 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 5 2 1 2 7:6 1 7
8 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 4 1 3 0 7:5 2 6
9 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 5 1 3 1 8:8 0 6
10 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 4 2 0 2 6:6 0 6
11 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 5 2 0 3 8:12 -4 6
12 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 4 1 2 1 4:3 1 5
13 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 5 1 1 3 3:5 -2 4
14 FC Pipinsried, Deutschland FC Pipinsried 4 1 0 3 4:11 -7 3
15 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 5 1 0 4 1:11 -10 3
16 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 4 0 1 3 3:9 -6 1
17 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 4 0 1 3 2:8 -6 1
18 FC Ingolstadt 04 II, Deutschland FC Ingolstadt 04 II 3 0 0 3 3:6 -3 0
  Playoffs
  Relegation
  Abstieg

# Durch den Abstieg der Profimannschaft des FC Ingolstadt 04 in die 3. Liga wurde der FC Ingolstadt 04 II mit 0 Punkten an das Ende der Tabelle gesetzt. Die erspielten Ergebnisse behalten aber ihre Gültigkeit. Das Team lag am Ende der Saison eigentlich mit 45 Punkten auf dem neunten Tabellenplatz.