# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Bayern München II, Deutschland Bayern München II 9 8 1 0 22:6 16 25
2 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 9 7 0 2 15:9 6 21
3 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 9 5 4 0 21:8 13 19
4 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 9 6 1 2 17:5 12 19
5 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 9 5 2 2 18:16 2 17
6 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 9 4 3 2 15:11 4 15
7 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 9 4 1 4 17:16 1 13
8 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 9 4 1 4 9:10 -1 13
9 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 9 3 3 3 14:14 0 12
10 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 9 3 2 4 13:12 1 11
11 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 9 3 2 4 13:13 0 11
12 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 9 3 1 5 14:19 -5 10
13 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 9 3 0 6 12:13 -1 9
14 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 9 2 2 5 9:17 -8 8
15 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 9 2 2 5 8:20 -12 8
16 FC Pipinsried, Deutschland FC Pipinsried 9 1 3 5 9:19 -10 6
17 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 9 1 1 7 4:17 -13 4
18 FC Ingolstadt 04 II, Deutschland FC Ingolstadt 04 II 9 2 1 6 9:14 -5 -38
  Playoffs
  Relegation
  Abstieg

# Durch den Abstieg der Profimannschaft des FC Ingolstadt 04 in die 3. Liga wurde der FC Ingolstadt 04 II mit 0 Punkten an das Ende der Tabelle gesetzt. Die erspielten Ergebnisse behalten aber ihre Gültigkeit. Das Team lag am Ende der Saison eigentlich mit 45 Punkten auf dem neunten Tabellenplatz.