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| 22.05.2009 | 19:00 | Waldhof Mannheim | - | SC Pfullendorf | 2:0 (1:0) | |
| 19:30 | SV Darmstadt 98 | - | Viktoria Aschaffenburg | 2:1 (1:0) | ||
| 23.05.2009 | 14:00 | Hessen Kassel | - | TSV 1860 München II | 3:4 (1:2) | |
| 14:00 | SC Freiburg II | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 5:0 (3:0) | ||
| 14:00 | SpVgg Greuther Fürth II | - | SSV Ulm 1846 | 1:1 (0:1) | ||
| 14:00 | SSV Reutlingen | - | Karlsruher SC II | 1:3 (1:0) | ||
| 14:00 | 1. FC Heidenheim 1846 | - | SpVgg Unterhaching II | 3:2 (3:1) | ||
| 16:00 | TSV Großbardorf | - | SV Wehen Wiesbaden II | 1:3 (0:0) | ||
| 24.05.2009 | 14:00 | Eintracht Frankfurt II | - | 1. FC Nürnberg II | 2:2 (0:1) |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
1. FC Heidenheim 1846 | 32 | 21 | 6 | 5 | 59:34 | 25 | 69 |
| 2 |
|
Hessen Kassel | 32 | 20 | 5 | 7 | 68:32 | 36 | 65 |
| 3 |
|
Eintracht Frankfurt II | 32 | 18 | 8 | 6 | 56:32 | 24 | 62 |
| 4 |
|
Waldhof Mannheim | 32 | 18 | 5 | 9 | 53:30 | 23 | 59 |
| 5 |
|
1. FC Nürnberg II | 32 | 16 | 9 | 7 | 61:36 | 25 | 57 |
| 6 |
|
SSV Ulm 1846 | 32 | 13 | 14 | 5 | 54:31 | 23 | 53 |
| 7 |
|
TSV 1860 München II | 32 | 14 | 7 | 11 | 53:41 | 12 | 49 |
| 8 |
|
SC Pfullendorf | 32 | 14 | 7 | 11 | 48:45 | 3 | 49 |
| 9 |
|
SV Wehen Wiesbaden II | 32 | 14 | 4 | 14 | 38:35 | 3 | 46 |
| 10 |
|
1. FC Eintracht Bamberg | 32 | 12 | 6 | 14 | 49:60 | -11 | 42 |
| 11 |
|
SpVgg Greuther Fürth II | 32 | 10 | 10 | 12 | 36:34 | 2 | 40 |
| 12 |
|
SC Freiburg II | 32 | 11 | 5 | 16 | 44:58 | -14 | 38 |
| 13 |
|
Viktoria Aschaffenburg | 32 | 8 | 12 | 12 | 36:42 | -6 | 36 |
| 14 |
|
SSV Reutlingen | 32 | 9 | 9 | 14 | 39:54 | -15 | 36 |
| 15 |
|
SV Darmstadt 98 | 32 | 8 | 10 | 14 | 38:49 | -11 | 34 |
| 16 |
|
Karlsruher SC II | 32 | 9 | 4 | 19 | 34:63 | -29 | 31 |
| 17 |
|
TSV Großbardorf | 32 | 4 | 6 | 22 | 30:79 | -49 | 18 |
| 18 |
|
SpVgg Unterhaching II | 32 | 3 | 5 | 24 | 30:71 | -41 | 14 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Das Spiel Unterhaching II - 1860 II (25. Spieltag) wurde wegen des Einsatzes eines nicht spielberechtigten Spielers mit 0:2 gewertet. # Viktoria Aschaffenburg hat aus finanziellen Gründen keine Lizenz für die Saison 2009/2010 beantragt und steht damit als Absteiger fest. |
