1. Spieltag 04.08.2006 Werder Bremen II - SV Wilhelmshaven 2:1
2. Spieltag 09.08.2006 SV Wilhelmshaven - Hertha BSC II 0:1
3. Spieltag 13.08.2006 1. FC Union Berlin - SV Wilhelmshaven 2:0
5. Spieltag 25.08.2006 SV Wilhelmshaven - Bayer Leverkusen II 2:1
6. Spieltag 02.09.2006 Kickers Emden - SV Wilhelmshaven 1:3
7. Spieltag 12.09.2006 SV Wilhelmshaven - FC St. Pauli 3:3 Tor
8. Spieltag 16.09.2006 Hamburger SV II - SV Wilhelmshaven 3:1
9. Spieltag 22.09.2006 SV Wilhelmshaven - Holstein Kiel 0:1
10. Spieltag 30.09.2006 Bor. Mönchengladbach II - SV Wilhelmshaven 0:0
11. Spieltag 14.10.2006 SV Wilhelmshaven - Rot Weiss Ahlen 4:1
12. Spieltag 20.10.2006 VfL Osnabrück - SV Wilhelmshaven 2:0
13. Spieltag 28.10.2006 SV Wilhelmshaven - Fortuna Düsseldorf 1:1
17. Spieltag 18.11.2006 SV Wilhelmshaven - Wuppertaler SV 2:1 gelbe Karte
18. Spieltag 25.11.2006 Borussia Dortmund II - SV Wilhelmshaven 2:1 gelbe Karte
19. Spieltag 02.12.2006 SV Wilhelmshaven - VfB Lübeck 1:3
22. Spieltag 16.02.2007 SV Wilhelmshaven - 1. FC Union Berlin 0:0 gelbe Karte
20. Spieltag 21.02.2007 SV Wilhelmshaven - Werder Bremen II 2:1
24. Spieltag 04.03.2007 Bayer Leverkusen II - SV Wilhelmshaven 1:1
21. Spieltag 07.03.2007 Hertha BSC II - SV Wilhelmshaven 2:2
25. Spieltag 13.03.2007 SV Wilhelmshaven - Kickers Emden 2:1
27. Spieltag 23.03.2007 SV Wilhelmshaven - Hamburger SV II 3:3 Tor
29. Spieltag 31.03.2007 SV Wilhelmshaven - Bor. Mönchengladbach II 1:2
30. Spieltag 07.04.2007 Rot Weiss Ahlen - SV Wilhelmshaven 1:0 gelbe Karte
35. Spieltag 12.05.2007 SV Wilhelmshaven - 1. FC Magdeburg 0:2 gelbe Karte
36. Spieltag 19.05.2007 Wuppertaler SV - SV Wilhelmshaven 5:2
38. Spieltag 02.06.2007 VfB Lübeck - SV Wilhelmshaven 6:0