2. Spieltag 19.08.2007 FC Carl Zeiss Jena - FC St. Pauli 0:1
3. Spieltag 26.08.2007 FC St. Pauli - TuS Koblenz 1:0
4. Spieltag 02.09.2007 SpVgg Greuther Fürth - FC St. Pauli 2:1
6. Spieltag 21.09.2007 TSV 1860 München - FC St. Pauli 2:1
8. Spieltag 28.09.2007 VfL Osnabrück - FC St. Pauli 3:1
9. Spieltag 07.10.2007 FC St. Pauli - SC Paderborn 07 2:1
10. Spieltag 21.10.2007 SC Freiburg - FC St. Pauli 2:0
11. Spieltag 26.10.2007 FC St. Pauli - SV Wehen Wiesbaden 1:1 gelbe Karte
12. Spieltag 02.11.2007 1899 Hoffenheim - FC St. Pauli 1:1
13. Spieltag 11.11.2007 FC St. Pauli - FC Augsburg 2:0
14. Spieltag 25.11.2007 Erzgebirge Aue - FC St. Pauli 0:0
16. Spieltag 07.12.2007 Alemannia Aachen - FC St. Pauli 2:2
17. Spieltag 14.12.2007 FC St. Pauli - 1. FSV Mainz 05 1:0 gelbe Karte
19. Spieltag 08.02.2008 FC St. Pauli - FC Carl Zeiss Jena 2:2 Tor
20. Spieltag 15.02.2008 TuS Koblenz - FC St. Pauli 1:1
21. Spieltag 24.02.2008 FC St. Pauli - SpVgg Greuther Fürth 1:1
22. Spieltag 02.03.2008 Kickers Offenbach - FC St. Pauli 4:3
24. Spieltag 16.03.2008 Bor. Mönchengladbach - FC St. Pauli 1:0
25. Spieltag 20.03.2008 FC St. Pauli - VfL Osnabrück 2:1 gelbe Karte
26. Spieltag 30.03.2008 SC Paderborn 07 - FC St. Pauli 4:1
27. Spieltag 06.04.2008 FC St. Pauli - SC Freiburg 5:0
28. Spieltag 11.04.2008 SV Wehen Wiesbaden - FC St. Pauli 1:3
29. Spieltag 16.04.2008 FC St. Pauli - 1899 Hoffenheim 3:1
30. Spieltag 27.04.2008 FC Augsburg - FC St. Pauli 1:0
31. Spieltag 02.05.2008 FC St. Pauli - Erzgebirge Aue 4:2
32. Spieltag 06.05.2008 1. FC Kaiserslautern - FC St. Pauli 2:0
33. Spieltag 11.05.2008 FC St. Pauli - Alemannia Aachen 0:2
34. Spieltag 18.05.2008 1. FSV Mainz 05 - FC St. Pauli 5:1 Tor