| 20. Spieltag | 04.02.2012 | FC Ingolstadt 04 | - | Fortuna Düsseldorf | 1:1 | ||||
| 21. Spieltag | 10.02.2012 | FSV Frankfurt | - | FC Ingolstadt 04 | 1:1 | ||||
| 22. Spieltag | 19.02.2012 | FC Ingolstadt 04 | - | SpVgg Greuther Fürth | 0:0 | ||||
| 23. Spieltag | 24.02.2012 | Hansa Rostock | - | FC Ingolstadt 04 | 1:2 | ||||
| 24. Spieltag | 02.03.2012 | FC Ingolstadt 04 | - | 1. FC Union Berlin | 3:3 | ||||
| 25. Spieltag | 11.03.2012 | Dynamo Dresden | - | FC Ingolstadt 04 | 0:0 | ||||
| 26. Spieltag | 17.03.2012 | FC Ingolstadt 04 | - | SC Paderborn 07 | 4:0 | ||||
| 27. Spieltag | 23.03.2012 | VfL Bochum | - | FC Ingolstadt 04 | 0:1 | ||||
| 28. Spieltag | 01.04.2012 | FC Ingolstadt 04 | - | MSV Duisburg | 1:1 | ||||
| 29. Spieltag | 08.04.2012 | FC Ingolstadt 04 | - | Alemannia Aachen | 3:3 | ||||
| 30. Spieltag | 11.04.2012 | Eintracht Frankfurt | - | FC Ingolstadt 04 | 1:1 | ||||
| 31. Spieltag | 15.04.2012 | FC Ingolstadt 04 | - | Karlsruher SC | 2:1 | ||||
| 32. Spieltag | 21.04.2012 | TSV 1860 München | - | FC Ingolstadt 04 | 4:1 |  |
|||
| 33. Spieltag | 29.04.2012 | FC Ingolstadt 04 | - | Energie Cottbus | 1:0 | ||||
| 34. Spieltag | 06.05.2012 | Eintracht Braunschweig | - | FC Ingolstadt 04 | 3:1 |
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