# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Bayern München II, Deutschland Bayern München II 33 19 8 6 35:12 23 65
2 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 33 16 12 5 28:13 15 60
3 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 33 16 10 7 29:16 13 58
4 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 33 14 14 5 24:11 13 56
5 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 33 14 9 10 28:23 5 51
6 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 33 13 11 9 22:17 5 50
7 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 33 12 11 10 23:19 4 47
8 FC Ingolstadt 04 II, Deutschland FC Ingolstadt 04 II 33 12 9 12 25:22 3 45
9 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 33 9 14 10 17:16 1 41
10 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 33 9 12 12 20:22 -2 39
11 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 33 9 10 14 18:23 -5 37
12 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 33 9 10 14 24:34 -10 37
13 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 33 7 15 11 18:27 -9 36
14 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 33 7 14 12 16:23 -7 35
15 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 33 5 19 9 13:21 -8 34
16 FC Pipinsried, Deutschland FC Pipinsried 33 8 8 17 17:32 -15 32
17 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 33 6 14 13 13:29 -16 32
18 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 33 5 14 14 15:25 -10 29
  Playoffs
  Relegation
  Abstieg

# Durch den Abstieg der Profimannschaft des FC Ingolstadt 04 in die 3. Liga wurde der FC Ingolstadt 04 II mit 0 Punkten an das Ende der Tabelle gesetzt. Die erspielten Ergebnisse behalten aber ihre Gültigkeit. Das Team lag am Ende der Saison eigentlich mit 45 Punkten auf dem neunten Tabellenplatz.