| 16. Spieltag | 06.12.2008 | Hansa Rostock II | - | Altona 93 | 2:1 | ||||
| 21. Spieltag | 07.03.2009 | Hansa Rostock II | - | VFC Plauen | 2:0 | ||||
| 22. Spieltag | 14.03.2009 | Chemnitzer FC | - | Hansa Rostock II | 2:0 | ||||
| 23. Spieltag | 22.03.2009 | Hansa Rostock II | - | Sachsen Leipzig | 3:2 |  |
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| 24. Spieltag | 28.03.2009 | Hannover 96 II | - | Hansa Rostock II | 1:1 | ||||
| 20. Spieltag | 01.04.2009 | FC Oberneuland | - | Hansa Rostock II | 3:0 |  |
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| 26. Spieltag | 18.04.2009 | Holstein Kiel | - | Hansa Rostock II | 1:1 |  |
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| 19. Spieltag | 22.04.2009 | Hansa Rostock II | - | VfL Wolfsburg II | 2:2 | ||||
| 27. Spieltag | 25.04.2009 | Hansa Rostock II | - | SV Wilhelmshaven | 2:5 | |
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| 28. Spieltag | 01.05.2009 | SV Babelsberg 03 | - | Hansa Rostock II | 2:0 | ||||
| 29. Spieltag | 08.05.2009 | Hansa Rostock II | - | 1. FC Magdeburg | 4:2 | |
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| 30. Spieltag | 13.05.2009 | Hallescher FC | - | Hansa Rostock II | 2:1 | |
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| 31. Spieltag | 19.05.2009 | Hansa Rostock II | - | Energie Cottbus II | 0:2 | ||||
| 32. Spieltag | 24.05.2009 | Hamburger SV II | - | Hansa Rostock II | 3:0 |
DR Kongo
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