| 12. Spieltag | 11.11.2006 | Bayer Leverkusen | - | Bayern München | 2:3 | ||||
| 13. Spieltag | 18.11.2006 | Bayern München | - | VfB Stuttgart | 2:1 | ||||
| 17. Spieltag | 16.12.2006 | 1. FSV Mainz 05 | - | Bayern München | 0:4 | ||||
| 23. Spieltag | 24.02.2007 | Bayern München | - | VfL Wolfsburg | 2:1 | ||||
| 27. Spieltag | 31.03.2007 | Bayern München | - | FC Schalke 04 | 2:0 | ||||
| 28. Spieltag | 07.04.2007 | Hannover 96 | - | Bayern München | 1:2 |  |
|||
| 29. Spieltag | 15.04.2007 | Bayern München | - | Bayer Leverkusen | 2:1 | ||||
| 30. Spieltag | 21.04.2007 | VfB Stuttgart | - | Bayern München | 2:0 | ||||
| 31. Spieltag | 28.04.2007 | Bayern München | - | Hamburger SV | 1:2 | ||||
| 32. Spieltag | 05.05.2007 | Bor. Mönchengladbach | - | Bayern München | 1:1 | |
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| 33. Spieltag | 12.05.2007 | Energie Cottbus | - | Bayern München | 0:3 | ||||
| 34. Spieltag | 19.05.2007 | Bayern München | - | 1. FSV Mainz 05 | 5:2 |
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