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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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MSV Duisburg | 28 | 13 | 12 | 3 | 21:7 | 14 | 51 |
| 2 |
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Alemannia Aachen | 28 | 13 | 9 | 6 | 27:12 | 15 | 48 |
| 3 |
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SpVgg Greuther Fürth | 28 | 12 | 10 | 6 | 20:15 | 5 | 46 |
| 4 |
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Eintracht Frankfurt | 28 | 12 | 8 | 8 | 24:18 | 6 | 44 |
| 5 |
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Erzgebirge Aue | 28 | 10 | 11 | 7 | 19:12 | 7 | 41 |
| 6 |
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TSV 1860 München | 28 | 9 | 13 | 6 | 20:14 | 6 | 40 |
| 7 |
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LR Ahlen | 28 | 8 | 13 | 7 | 16:16 | 0 | 37 |
| 8 |
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Karlsruher SC | 28 | 9 | 9 | 10 | 19:22 | -3 | 36 |
| 9 |
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Wacker Burghausen | 28 | 9 | 9 | 10 | 13:17 | -4 | 36 |
| 10 |
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1. FC Köln | 28 | 7 | 13 | 8 | 20:13 | 7 | 34 |
| 11 |
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Rot-Weiss Essen | 28 | 7 | 13 | 8 | 14:19 | -5 | 34 |
| 12 |
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Energie Cottbus | 28 | 6 | 15 | 7 | 13:16 | -3 | 33 |
| 13 |
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Dynamo Dresden | 28 | 8 | 8 | 12 | 16:21 | -5 | 32 |
| 14 |
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1. FC Saarbrücken | 28 | 9 | 5 | 14 | 16:23 | -7 | 32 |
| 15 |
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Rot-Weiß Oberhausen | 28 | 8 | 8 | 12 | 14:24 | -10 | 32 |
| 16 |
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SpVgg Unterhaching | 28 | 8 | 7 | 13 | 17:19 | -2 | 31 |
| 17 |
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Eintracht Trier | 28 | 6 | 12 | 10 | 16:21 | -5 | 30 |
| 18 |
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Rot-Weiß Erfurt | 28 | 5 | 11 | 12 | 10:26 | -16 | 26 |
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# Das Spiel LR Ahlen - Wacker Burghausen (1:0, 9. Spieltag) wurde wegen des Wettskandals annulliert. Das Wiederholungsspiel gewannen die Gäste mit 3:1. # Das Spiel Rot-Weiß Erfurt - SpVgg Unterhaching (24. Spieltag, 2:0) wurde mit 0:2 gewertet. Der Erfurter Senad Tiganj wurde des Dopings überführt. |
