| 19. Spieltag | 26.01.2025 | Hannover 96 | - | Preußen Münster | 2:2 |  |
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| 20. Spieltag | 02.02.2025 | 1. FC Kaiserslautern | - | Preußen Münster | 2:1 | ||||
| 21. Spieltag | 07.02.2025 | Preußen Münster | - | Hamburger SV | 1:2 | ||||
| 22. Spieltag | 14.02.2025 | SC Paderborn 07 | - | Preußen Münster | 2:0 | ||||
| 23. Spieltag | 22.02.2025 | Preußen Münster | - | Jahn Regensburg | 2:0 | ||||
| 24. Spieltag | 28.02.2025 | FC Schalke 04 | - | Preußen Münster | 1:0 | ||||
| 25. Spieltag | 09.03.2025 | Preußen Münster | - | 1. FC Nürnberg | 0:1 |  |
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| 26. Spieltag | 15.03.2025 | SV 07 Elversberg | - | Preußen Münster | 0:1 | ||||
| 27. Spieltag | 30.03.2025 | Preußen Münster | - | Eintracht Braunschweig | 1:1 | ||||
| 28. Spieltag | 05.04.2025 | Fortuna Düsseldorf | - | Preußen Münster | 1:0 | ||||
| 29. Spieltag | 13.04.2025 | Preußen Münster | - | Karlsruher SC | 1:1 | ||||
| 30. Spieltag | 20.04.2025 | 1. FC Köln | - | Preußen Münster | 3:1 | ||||
| 31. Spieltag | 26.04.2025 | Preußen Münster | - | SV Darmstadt 98 | 1:1 | ||||
| 32. Spieltag | 02.05.2025 | 1. FC Magdeburg | - | Preußen Münster | 0:5 | ||||
| 34. Spieltag | 18.05.2025 | SSV Ulm 1846 | - | Preußen Münster | 2:2 |
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