1. Spieltag 13.08.1999 Energie Cottbus - Fortuna Köln 2:0
2. Spieltag 22.08.1999 Fortuna Köln - 1. FSV Mainz 05 2:1
3. Spieltag 29.08.1999 1. FC Nürnberg - Fortuna Köln 2:1
4. Spieltag 12.09.1999 Fortuna Köln - Chemnitzer FC 1:0
5. Spieltag 19.09.1999 Hannover 96 - Fortuna Köln 3:1
6. Spieltag 25.09.1999 Fortuna Köln - Karlsruher SC 2:3
7. Spieltag 01.10.1999 Alemannia Aachen - Fortuna Köln 1:1
8. Spieltag 15.10.1999 Fortuna Köln - FC St. Pauli 2:0
9. Spieltag 25.10.1999 1. FC Köln - Fortuna Köln 3:0
10. Spieltag 31.10.1999 Fortuna Köln - Rot-Weiß Oberhausen 0:0
11. Spieltag 07.11.1999 SpVgg Greuther Fürth - Fortuna Köln 0:0
12. Spieltag 19.11.1999 Fortuna Köln - Stuttgarter Kickers 1:1
13. Spieltag 27.11.1999 VfL Bochum - Fortuna Köln 3:0 gelbe Karte
14. Spieltag 05.12.1999 Fortuna Köln - TeBe Berlin 0:0
15. Spieltag 12.12.1999 Bor. Mönchengladbach - Fortuna Köln 0:0
16. Spieltag 15.12.1999 Fortuna Köln - Waldhof Mannheim 1:5
17. Spieltag 19.12.1999 Kickers Offenbach - Fortuna Köln 4:3
18. Spieltag 13.02.2000 Fortuna Köln - Energie Cottbus 2:0
19. Spieltag 20.02.2000 1. FSV Mainz 05 - Fortuna Köln 0:0
20. Spieltag 27.02.2000 Fortuna Köln - 1. FC Nürnberg 1:1
21. Spieltag 03.03.2000 Chemnitzer FC - Fortuna Köln 2:1
22. Spieltag 12.03.2000 Fortuna Köln - Hannover 96 1:1 gelbe Karte
23. Spieltag 19.03.2000 Karlsruher SC - Fortuna Köln 2:1 gelbe Karte
24. Spieltag 26.03.2000 Fortuna Köln - Alemannia Aachen 0:0
25. Spieltag 02.04.2000 FC St. Pauli - Fortuna Köln 0:0
26. Spieltag 09.04.2000 Fortuna Köln - 1. FC Köln 4:1
27. Spieltag 16.04.2000 Rot-Weiß Oberhausen - Fortuna Köln 4:0
28. Spieltag 23.04.2000 Fortuna Köln - SpVgg Greuther Fürth 0:1 gelbe Karte
29. Spieltag 30.04.2000 Stuttgarter Kickers - Fortuna Köln 2:1
30. Spieltag 06.05.2000 Fortuna Köln - VfL Bochum 2:3
31. Spieltag 12.05.2000 TeBe Berlin - Fortuna Köln 1:2
32. Spieltag 18.05.2000 Fortuna Köln - Bor. Mönchengladbach 1:2 rote Karte