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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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SC Paderborn 07 | 26 | 15 | 8 | 3 | 28:9 | 19 | 53 |
| 2 |
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SV Wehen Wiesbaden | 26 | 11 | 11 | 4 | 25:9 | 16 | 44 |
| 3 |
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1. FC Magdeburg | 26 | 10 | 10 | 6 | 27:14 | 13 | 40 |
| 4 |
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Hansa Rostock | 26 | 10 | 10 | 6 | 15:10 | 5 | 40 |
| 5 |
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Karlsruher SC | 26 | 9 | 12 | 5 | 13:10 | 3 | 39 |
| 6 |
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SV Meppen | 26 | 9 | 10 | 7 | 14:11 | 3 | 37 |
| 7 |
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VfR Aalen | 26 | 8 | 12 | 6 | 16:13 | 3 | 36 |
| 8 |
|
Fortuna Köln | 26 | 7 | 14 | 5 | 18:15 | 3 | 35 |
| 9 |
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FC Carl Zeiss Jena | 26 | 6 | 16 | 4 | 13:11 | 2 | 34 |
| 10 |
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FSV Zwickau | 26 | 9 | 7 | 10 | 16:17 | -1 | 34 |
| 11 |
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VfL Osnabrück | 26 | 8 | 8 | 10 | 16:21 | -5 | 32 |
| 12 |
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Würzburger Kickers | 26 | 7 | 9 | 10 | 9:14 | -5 | 30 |
| 13 |
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Chemnitzer FC | 26 | 6 | 12 | 8 | 14:20 | -6 | 30 |
| 14 |
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Hallescher FC | 26 | 6 | 11 | 9 | 15:18 | -3 | 29 |
| 15 |
|
Werder Bremen II | 26 | 5 | 14 | 7 | 12:19 | -7 | 29 |
| 16 |
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SG Sonnenhof Großaspach | 26 | 6 | 10 | 10 | 12:22 | -10 | 28 |
| 17 |
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SpVgg Unterhaching | 26 | 6 | 9 | 11 | 15:18 | -3 | 27 |
| 18 |
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Sportfreunde Lotte | 26 | 5 | 12 | 9 | 16:22 | -6 | 27 |
| 19 |
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Preußen Münster | 26 | 6 | 9 | 11 | 12:20 | -8 | 27 |
| 20 |
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Rot-Weiß Erfurt | 26 | 2 | 14 | 10 | 5:18 | -13 | 20 |
| Aufstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen. # Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. |
