 |
 |
|
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
SC Paderborn 07 | 21 | 11 | 6 | 4 | 19:8 | 11 | 39 |
| 2 |
|
1. FC Union Berlin | 21 | 9 | 9 | 3 | 14:6 | 8 | 36 |
| 3 |
|
Kickers Emden | 21 | 9 | 8 | 4 | 14:5 | 9 | 35 |
| 4 |
|
SV Sandhausen | 21 | 9 | 7 | 5 | 14:10 | 4 | 34 |
| 5 |
|
SpVgg Unterhaching | 21 | 8 | 7 | 6 | 15:12 | 3 | 31 |
| 6 |
|
Eintracht Braunschweig | 21 | 8 | 7 | 6 | 15:13 | 2 | 31 |
| 7 |
|
Bayern München II | 21 | 7 | 10 | 4 | 9:7 | 2 | 31 |
| 8 |
|
VfB Stuttgart II | 21 | 8 | 6 | 7 | 17:11 | 6 | 30 |
| 9 |
|
Rot-Weiß Erfurt | 21 | 7 | 9 | 5 | 14:9 | 5 | 30 |
| 10 |
|
Fortuna Düsseldorf | 21 | 6 | 10 | 5 | 12:8 | 4 | 28 |
| 11 |
|
Werder Bremen II | 21 | 4 | 13 | 4 | 13:16 | -3 | 25 |
| 12 |
|
Kickers Offenbach | 21 | 5 | 9 | 7 | 7:9 | -2 | 24 |
| 13 |
|
Wacker Burghausen | 21 | 5 | 9 | 7 | 12:15 | -3 | 24 |
| 14 |
|
Erzgebirge Aue | 21 | 5 | 8 | 8 | 11:16 | -5 | 23 |
| 15 |
|
FC Carl Zeiss Jena | 21 | 5 | 8 | 8 | 8:18 | -10 | 23 |
| 16 |
|
Stuttgarter Kickers | 21 | 3 | 13 | 5 | 13:16 | -3 | 22 |
| 17 |
|
VfR Aalen | 21 | 3 | 11 | 7 | 6:13 | -7 | 20 |
| 18 |
|
Dynamo Dresden | 21 | 3 | 10 | 8 | 9:15 | -6 | 19 |
| 19 |
|
Jahn Regensburg | 21 | 3 | 9 | 9 | 5:12 | -7 | 18 |
| 20 |
|
Wuppertaler SV | 21 | 2 | 11 | 8 | 7:15 | -8 | 17 |
| Aufstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg |
|
# Den Stuttgarter Kickers wurden drei Punkte wegen eines nicht fristgerecht zurückgezahlten Darlehens aus dem DFB-Kautionsfond abgezogen. # Kickers Emden hat die Lizenz für die Saison 2009/2010 zurückgezogen und steht somit als Absteiger fest. Infolgedessen hat Wacker Burghausen die Klasse gehalten. |
