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| 23.04.1999 | 19:00 | FC St. Pauli | - | 1. FSV Mainz 05 | 2:1 (0:1) | |
| 19:00 | Energie Cottbus | - | SSV Ulm 1846 | 3:0 (1:0) | ||
| 19:00 | Fortuna Düsseldorf | - | 1. FC Köln | 2:1 (1:0) | ||
| 25.04.1999 | 15:00 | TeBe Berlin | - | SG Wattenscheid 09 | 1:0 (1:0) | |
| 15:00 | Rot-Weiß Oberhausen | - | Hannover 96 | 1:1 (0:1) | ||
| 15:00 | Stuttgarter Kickers | - | Karlsruher SC | 2:2 (2:1) | ||
| 15:00 | Fortuna Köln | - | SpVgg Unterhaching | 0:2 (0:0) | ||
| 15:00 | KFC Uerdingen 05 | - | Arminia Bielefeld | 0:4 (0:1) | ||
| 26.04.1999 | 20:15 | FC Gütersloh | - | SpVgg Greuther Fürth | 1:0 (0:0) |
| » Tabelle | Heim | Auswärts | Hinrunde | Rückrunde | 1. Halbzeit | 2. Halbzeit |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
Arminia Bielefeld | 27 | 16 | 5 | 6 | 47:24 | 23 | 53 |
| 2 |
|
SpVgg Unterhaching | 27 | 16 | 4 | 7 | 36:20 | 16 | 52 |
| 3 |
|
SpVgg Greuther Fürth | 27 | 13 | 8 | 6 | 36:20 | 16 | 47 |
| 4 |
|
TeBe Berlin | 27 | 14 | 5 | 8 | 42:34 | 8 | 47 |
| 5 |
|
Hannover 96 | 27 | 13 | 5 | 9 | 40:28 | 12 | 44 |
| 6 |
|
Karlsruher SC | 27 | 14 | 2 | 11 | 45:36 | 9 | 44 |
| 7 |
|
SSV Ulm 1846 | 27 | 11 | 11 | 5 | 50:43 | 7 | 44 |
| 8 |
|
1. FSV Mainz 05 | 27 | 11 | 6 | 10 | 37:37 | 0 | 39 |
| 9 |
|
Fortuna Köln | 27 | 9 | 8 | 10 | 41:44 | -3 | 35 |
| 10 |
|
Stuttgarter Kickers | 27 | 9 | 7 | 11 | 27:36 | -9 | 34 |
| 11 |
|
1. FC Köln | 27 | 8 | 9 | 10 | 34:42 | -8 | 33 |
| 12 |
|
FC St. Pauli | 27 | 8 | 6 | 13 | 31:41 | -10 | 30 |
| 13 |
|
Rot-Weiß Oberhausen | 27 | 6 | 12 | 9 | 30:40 | -10 | 30 |
| 14 |
|
Energie Cottbus | 27 | 6 | 10 | 11 | 32:35 | -3 | 28 |
| 15 |
|
FC Gütersloh | 27 | 7 | 7 | 13 | 32:44 | -12 | 28 |
| 16 |
|
SG Wattenscheid 09 | 27 | 6 | 8 | 13 | 22:33 | -11 | 26 |
| 17 |
|
Fortuna Düsseldorf | 27 | 4 | 12 | 11 | 29:41 | -12 | 24 |
| 18 |
|
KFC Uerdingen 05 | 27 | 5 | 9 | 13 | 27:40 | -13 | 24 |
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# Durch die erste Linie sind die Aufstiegsplätze gekennzeichnet, durch die zweite die Abstiegsplätze. |
