 |
 |
|
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
SC Paderborn 07 | 13 | 8 | 4 | 1 | 11:3 | 8 | 28 |
| 2 |
|
SV Sandhausen | 13 | 8 | 2 | 3 | 9:5 | 4 | 26 |
| 3 |
|
Kickers Emden | 13 | 6 | 5 | 2 | 9:3 | 6 | 23 |
| 4 |
|
Fortuna Düsseldorf | 13 | 5 | 6 | 2 | 9:3 | 6 | 21 |
| 5 |
|
Rot-Weiß Erfurt | 13 | 5 | 5 | 3 | 12:7 | 5 | 20 |
| 6 |
|
1. FC Union Berlin | 13 | 4 | 8 | 1 | 8:4 | 4 | 20 |
| 7 |
|
Bayern München II | 13 | 5 | 5 | 3 | 7:6 | 1 | 20 |
| 8 |
|
VfB Stuttgart II | 13 | 5 | 4 | 4 | 11:8 | 3 | 19 |
| 9 |
|
Werder Bremen II | 13 | 2 | 10 | 1 | 9:7 | 2 | 16 |
| 10 |
|
Eintracht Braunschweig | 13 | 4 | 4 | 5 | 9:10 | -1 | 16 |
| 11 |
|
FC Carl Zeiss Jena | 13 | 4 | 4 | 5 | 6:11 | -5 | 16 |
| 12 |
|
Wacker Burghausen | 13 | 4 | 3 | 6 | 10:12 | -2 | 15 |
| 13 |
|
Erzgebirge Aue | 13 | 2 | 7 | 4 | 6:7 | -1 | 13 |
| 14 |
|
SpVgg Unterhaching | 13 | 2 | 7 | 4 | 5:8 | -3 | 13 |
| 15 |
|
Wuppertaler SV | 13 | 2 | 7 | 4 | 4:7 | -3 | 13 |
| 16 |
|
Stuttgarter Kickers | 13 | 2 | 7 | 4 | 8:13 | -5 | 13 |
| 17 |
|
VfR Aalen | 13 | 2 | 6 | 5 | 4:8 | -4 | 12 |
| 18 |
|
Kickers Offenbach | 13 | 2 | 5 | 6 | 4:8 | -4 | 11 |
| 19 |
|
Dynamo Dresden | 13 | 1 | 7 | 5 | 3:8 | -5 | 10 |
| 20 |
|
Jahn Regensburg | 13 | 1 | 6 | 6 | 3:9 | -6 | 9 |
| Aufstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg |
|
# Den Stuttgarter Kickers wurden drei Punkte wegen eines nicht fristgerecht zurückgezahlten Darlehens aus dem DFB-Kautionsfond abgezogen. # Kickers Emden hat die Lizenz für die Saison 2009/2010 zurückgezogen und steht somit als Absteiger fest. Infolgedessen hat Wacker Burghausen die Klasse gehalten. |
