1. Spieltag 06.08.2012 1. FC Kaiserslautern - 1. FC Union Berlin 3:3
2. Spieltag 12.08.2012 1. FC Union Berlin - Eintracht Braunschweig 0:1
3. Spieltag 24.08.2012 SV Sandhausen - 1. FC Union Berlin 2:0
4. Spieltag 03.09.2012 1. FC Union Berlin - Hertha BSC 1:2
5. Spieltag 14.09.2012 FC Ingolstadt 04 - 1. FC Union Berlin 2:1
6. Spieltag 21.09.2012 1. FC Union Berlin - 1. FC Köln 2:1
7. Spieltag 26.09.2012 Erzgebirge Aue - 1. FC Union Berlin 1:1
8. Spieltag 29.09.2012 1. FC Union Berlin - Energie Cottbus 3:1
9. Spieltag 05.10.2012 FC St. Pauli - 1. FC Union Berlin 2:2
10. Spieltag 21.10.2012 1. FC Union Berlin - FSV Frankfurt 1:0 gelbe Karte
11. Spieltag 28.10.2012 1. FC Union Berlin - SC Paderborn 07 0:1
12. Spieltag 04.11.2012 Dynamo Dresden - 1. FC Union Berlin 0:2
13. Spieltag 10.11.2012 1. FC Union Berlin - VfR Aalen 0:0
14. Spieltag 18.11.2012 Jahn Regensburg - 1. FC Union Berlin 3:3
15. Spieltag 24.11.2012 1. FC Union Berlin - TSV 1860 München 2:2 Tor
16. Spieltag 28.11.2012 MSV Duisburg - 1. FC Union Berlin 1:2
17. Spieltag 01.12.2012 1. FC Union Berlin - VfL Bochum 2:1
18. Spieltag 07.12.2012 1. FC Union Berlin - 1. FC Kaiserslautern 2:0
19. Spieltag 17.12.2012 Eintracht Braunschweig - 1. FC Union Berlin 4:3
21. Spieltag 11.02.2013 Hertha BSC - 1. FC Union Berlin 2:2
22. Spieltag 16.02.2013 1. FC Union Berlin - FC Ingolstadt 04 1:1
23. Spieltag 23.02.2013 1. FC Köln - 1. FC Union Berlin 2:0
24. Spieltag 01.03.2013 1. FC Union Berlin - Erzgebirge Aue 3:0
25. Spieltag 09.03.2013 Energie Cottbus - 1. FC Union Berlin 2:1
26. Spieltag 15.03.2013 1. FC Union Berlin - FC St. Pauli 4:2
27. Spieltag 31.03.2013 FSV Frankfurt - 1. FC Union Berlin 3:0
28. Spieltag 07.04.2013 SC Paderborn 07 - 1. FC Union Berlin 1:1
31. Spieltag 26.04.2013 1. FC Union Berlin - Jahn Regensburg 1:0
32. Spieltag 05.05.2013 TSV 1860 München - 1. FC Union Berlin 3:0
33. Spieltag 12.05.2013 1. FC Union Berlin - MSV Duisburg 2:1